Na delu, kjer poteka kanal S1, poteka vzporedno s Savo tudi plansko načrtovana obvoznica Krško. Trasa kanala je predvidena v vznožju na nevodni strani njenega nasipa.

Začetek trase je iz zadrževalnega bazena ZB-1, ki bo zgrajen na desnem bregu reke Save, ob vhodu v staro mestno jedro mesta Krško. Trasa od ZB-1 do ZB-2 poteka vzporedno s koritom reke Save in plansko načrtovano obvoznico Krško ter poteka pod mostom čez reko Savo. Od ZB-1 do ZB-2 bo kanal zgrajen v dolžini cca 980 m, DN 300.

Od ZB-2 do ZB-3 trasa poteka med reko Savo in stadionom Matije Gubca in prečka Leskovški potok (Vejarček). Na tem odseku bo kolektor zgrajen v dolžini cca 765 m, DN 400.

Od črpališča Krško na desnem bregu Save (lociran ob ZB-3) do priključka na kanal S2 na levem bregu bo zgrajen tlačni vod, dolžine cca 300 m, d=315. Trasa tlačnega voda bo prečkala reko Savo in lokalno LC 191111 Krški most - Vrbina - Sp. Stari grad.

Dolžina kanala S1 je cca 2045 m.